安徽华皖种业有限公司（以下简称华皖公司）成立于2004年6月，2017年之前是安徽隆平高科种业有限公司旗下的全资子公司，属法人独资的有限责任公司，注册资本3000万人民币。2017年6月缘于隆平高科加盟央企中信集团后内部管理体制改革，小麦专业公司正式从安徽隆平高科种业有限公司里分离出来，由安徽隆平的子公司升格为中信集团隆平高科控股的子公司，并沿用华皖种业的名称。